Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPCP11686 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms