Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2AF1L5P0DN76 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms