Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFLP07196 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFLP07196 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms