Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms