Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIPRLO75663 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms