Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRMUO75648 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms