Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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