Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms