Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMARCA5O60264 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms