Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms