Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms