Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms