Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
J3QR89 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
J3QR89 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
J3QR89 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms