Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms