Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms