Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINLQ9Y2I6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms