Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms