Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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