Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP8AP2Q9UKL3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP8AP2Q9UKL3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms