Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms