Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPHK1Q9NYA1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPHK1Q9NYA1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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