Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT57Q9NWB7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms