Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLIMQ9NVW2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms