Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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