Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms