Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms