Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf88Q9H8K7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms