Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms