Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms