Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms