Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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