Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB11FIP5Q9BXF6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms