Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms