Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms