Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms