Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms