Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms