Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms