Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms