Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms