Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKD2Q969F2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms