Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms