Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF3AQ92664 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF3AQ92664 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms