Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms