Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLGN4YQ8NFZ3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLGN4YQ8NFZ3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms