Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms