Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms