Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SVOPQ8N4V2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms