Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms