Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TRAPPC6BQ86SZ2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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